Пенополиэтилен является инертным полимерным химически стойким материалом, токсикологически безвредным,  допускающий контакт с пищевыми продуктами и кожей человека.

При температуре до +140 градусов °С выделение токсических веществ из материала не происходит. Стандартные марки пенополиэтилена (без огнегасящих добавок) являются горючим материалом. При возникновении пожара его следует тушить всеми известными средствами пожаротушения: пенными и углекислотными огнетушителями, песком, водой, асбестовым полотном. При попадании расплава пены на кожу ее следует охладить водой, затем удалить.

Пенополиэтилен не растворим в воде и большинстве растворителей. При производстве пенополиэтилена не применяются и сам пенополиэтилен не содержит веществ, разрушающих озоновый слой атмосферы. При захоронении в земле не происходит выделение газов или веществ, загрязняющих водоемы.

Отходы пенополиэтилена рекомендуется сжигать в промышленных установках, имеющих высокие температуры. Отходы пенополиэтилена могут быть повторно использованы в качестве: упаковочного и теплоизоляционного материала, легкого наполнителя при изготовлении строительных материалов, дренажирующего субстрата.